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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
日本首相岸田文雄开启欧美五国访问行程 首站到访法国******
中新社巴黎1月9日电 (记者 李洋)日本首相岸田文雄9日起开启为期一周的欧美五国访问行程，首站到访法国。
当地时间1月9日晚，法国总统马克龙在巴黎爱丽舍宫会见日本首相岸田文雄。 中新社记者 李洋 摄岸田文雄当天乘专机抵达巴黎。马克龙当晚在总统府爱丽舍宫会见岸田文雄，两人共同出席记者会并共进工作晚宴。根据官方通报，马克龙与岸田文雄讨论了俄乌局势，特别是由此导致的能源和粮食安全问题。马克龙感谢日本对乌克兰的经济和人道主义支持。
马克龙与岸田文雄还谈及亚太地区安全局势，包括朝鲜半岛核问题等。两人也谈及法日两国合作的相关议题，包括清洁能源、应对气候变化等。据法国官员透露，马克龙与岸田文雄均对美国的《通胀削减法案》(IRA)使北美生产的电动车等产品受益表达关切。
在正式会谈前，马克龙还与岸田文雄一同参观了巴黎圣母院。巴黎圣母院2019年4月遭遇大火，目前仍在重建中，预计有望按原计划于2024年重新对外开放。
日本是2023年七国集团(G7)轮值主席国。据日本官方介绍，岸田文雄此次欧美五国访问行程旨在推动相关国家为5月在日本广岛召开的七国集团峰会展开合作。
在访问法国后，岸田文雄还将访问意大利、英国、加拿大和美国，分别与意大利总理梅洛尼、英国首相苏纳克、加拿大总理特鲁多和美国总统拜登举行会谈。按计划，他将于15日结束此次访问行程回国。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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